- Franchise
Drei Monate sind vergangen, seit Tal-Rho besiegt wurde und Natalie angekommen ist. Lois ist unzufrieden mit den Interviewpartnern, die Chrissy für den "Gazette" ausgewählt hat, und tadelt Jonathan, da er fast mit einem Mädchen geschlafen hätte. Lana unterstützt den Bürgermeisterkandidaten Daniel Hart im Wahlkampf gegen Bürgermeister George Dean. Während er ein nordkoreanisches U-Boot rettet, hat Superman eine schmerzhafte Vision und erlebt dies erneut bei einem Erdbeben. Er sieht, wie ein Team junger Personen mit Superkräften Menschen aus den Minen rettet und erfährt, dass sie für Lt. Gen. Mitch Anderson und das DOD arbeiten, weil Superman sich weigert, Amerika den Vorrang vor dem Rest der Welt zu geben. Unterdessen kehrt Sarah vom Camp nach Hause zurück, verhält sich jedoch distanziert gegenüber Jordan. In Metropolis hat Natalie Schwierigkeiten, sich an ihr neues Leben zu gewöhnen. John nimmt Kontakt mit Lois auf, die mit Natalie spricht und ihr sowie John erlaubt, bei ihnen zu bleiben. Tief in den Minen schlägt eine gigantische Hand durch eine der Wände.
Clark hat erneut eine Vision und sucht Tal-Rho auf, der behauptet, er sei machtlos, aber bereit zu helfen, wenn er zu seiner Festung gebracht wird. Clark lehnt ab, doch eine weitere Vision hindert ihn später daran, Phillip Karnowski zu besiegen, sodass Andersons Team, zu dem nun auch Tag Harris gehört, eingreift.
Unterdessen ignoriert Lois die Warnung eines alten Informanten, die die ''Gazette'' bedroht, und führt zusammen mit Chrissy ein Interview mit Dr. Faulkner über die Erschütterungen in den Minen. Hart steigt aus dem Rennen aus, während sich Natalie mit Sarah anfreundet.
Clark und Jordan nehmen schließlich Tal-Rhos Angebot an. Er erweckt ein Hologramm von Lara, ihrer und Clarks Mutter. Während einer weiteren Erschütterung greift ein Monster in den Minen eine Gruppe an und Clark hat eine weitere Vision. Tal-Rho, der über seine Kräfte gelogen hat, kämpft kurz gegen Jordan. Lara stellt fest, dass die Visionen durch ein kosmologisches Ereignis verursacht werden, das mit den Erschütterungen zusammenfällt.
In dieser Nacht wird Tal-Rho zurück ins Gefängnis gebracht, Lana entschließt sich, für das Bürgermeisteramt zu kandidieren, und Jonathan vermutet, dass sein Teamkollege Timmy Steroide nimmt. Sarah gesteht Jordan, dass sie im Camp ein Mädchen namens Aubrey geküsst hat. Dr. Faulkner informiert ihren Chef über das, was in den Minen gefunden wurde, und Lois offenbart Chrissy, dass ihr alter Informant ihre Schwester Lucy Lane ist.
Clark kämpft zunehmend mit seinen Visionen, die zu Wutausbrüchen gegenüber Jordan und Jonathan führen. Lana setzt ihre Wahlkampagne fort, obwohl die Bürger nach dem Vorfall mit Tal-Rho zweifeln. Sam rät Clark, seine Differenzen mit Anderson beizulegen, und sorgt dafür, dass John Zugang zu den Minen erhält. Lois und Sam diskutieren Sams Zögern, mit Lucy Kontakt aufzunehmen, da diese fast Selbstmord beging, während sie in Ally Allstons Kult war.
In den Minen entdeckt John einen gesprengten Stein und wird von Faulkner niedergeschlagen. Nach einer weiteren Detonation taucht eine geheimnisvolle Gestalt in einem Metallanzug auf und kämpft gegen Superman. John kommt wieder zu Bewusstsein und schafft es, einen Teil des Helms der Gestalt zu zerstören. Sowohl Superman als auch die Gestalt leiden unter intensiveren Visionen, weshalb die Gestalt flieht. Natalie stellt ihren Vater zur Rede, warum er weiterhin in der Rüstung kämpft.
Unterdessen ist Jordan unsicher, wie er seine Beziehung zu Sarah fortsetzen soll, entschuldigt sich aber schließlich und schenkt ihr Marthas Halskette als Zeichen seiner Hingabe. Jonathan entdeckt, dass seine Freundin Candice eine kristalline Substanz verkauft und bittet sie um etwas davon. Sam organisiert ein persönliches Treffen zwischen Lois und Lucy, doch stattdessen erscheint Ally. In der Arktis wird enthüllt, dass die geheimnisvolle Gestalt Bizarro ist, eine vernarbte, blasse Version von Superman mit einem spiegelverkehrten Abzeichen auf seinem Anzug.
Vor fünf Jahren verließ Lucy die gemeinsame Wohnung der Kents, nachdem sie sich mit Lois wegen Ally gestritten hatte. In der Gegenwart bedroht Ally Lois. Chrissy, als Penelope Collins getarnt, besucht Allys Veranstaltung zur "Inverse Method". Dort stellt Lucy Lois zur Rede. Ally durchschaut Chrissys Verkleidung und zeigt live Aufnahmen von Lois, die zugibt, Details über Lucys Begegnung mit ihrem "anderen Ich" in ihrem Artikel über Ally weggelassen zu haben. Dies belastet die Freundschaft zwischen Lois und Chrissy stark.
Währenddessen greift eine Superman-ähnliche Gestalt Clark in der Scheune an, wird jedoch von John zurückgeschlagen. Danach gibt John Clark die Energieergebnisse mit der Bitte, diese an Anderson zu übermitteln. Entgegen Clarks Rat greift Andersons Team die Gestalt bei Salar de Uyuni an. Clark und John kommen hinzu, doch während des Kampfes kommen zwei Teammitglieder ums Leben. Tag entkommt mit dem Schmuckstück der Gestalt, und John wird verletzt und ins Krankenhaus gebracht. Parallel dazu beginnt Jonathan, eine Kristallsubstanz einzunehmen.
Am Abend verspricht Dean, das Familienunternehmen der Cushings aus dem Wahlkampf herauszuhalten. Kyle trifft sich mit einer Barkeeperin, Sam stimmt zu, Jordan heimlich zu trainieren, und Chrissy kontaktiert Ally, um Informationen über Lois zu erhalten.
Lois fragt sich, ob der Kult mit der mysteriösen Figur verbunden ist. Sie entdeckt, dass Faulkner ein Mitglied ist, aber als sie sie besucht, merkt sie, dass die Figur Faulkner getötet hat und nun Ally verfolgt. Chrissy trifft Ally, die ihr ein geheimnisvolles Amulett aufdrängt, wodurch Chrissy eine „bizarro“ Version von sich selbst in einer anderen Welt sieht. Superman schützt Ally vor der Figur, die er als sein anderes Ich erkennt. Nach einem Kampf besiegt Superman dieses andere Ich und bringt es zu Lara.
Währenddessen begleitet Sam Jonathan zu Jordans Training. Jonathan nimmt jedoch eine unbekannte Substanz und wird aggressiv. Am Abend, während Sarahs Quinceañera, erfährt Kyle von Tonya, der Barkeeperin, mit der er einst eine Affäre hatte, dass ihre Freundin droht, die Affäre Dean zu verraten. Sarah belauscht das Gespräch und erzählt es Lana in Kyles Beisein.
Chrissy berichtet Lois, dass Allys anderes Ich die Kontrolle über die alternative Welt übernommen hat. Jonathan entwickelt durch die Substanz Kräfte und behauptet, sie seien von ihm selbst, um Jordan zu beeindrucken. In Tal-Rhos Festung warnt Clarks anderes Ich, dass Ally alles zerstören wird, was ihm wichtig ist, wenn er sie nicht aufhält.
Supermans anderes Ich warnt davor, dass Ally, wenn sie beide Anhänger erlangt, gottähnliche Kräfte entwickeln könnte und dass er nicht in der Lage sei, diese zu zerstören. Währenddessen wird Anderson von seinem Vorgesetzten General Hardcastle wegen seiner unzureichenden Zusammenarbeit mit Superman kritisiert. Kyle versucht, sich bei Lana zu entschuldigen, doch sie weist ihn ab. Später erfährt Lana von Tonya, dass Kyle die Beziehung vor zwei Jahren kurz nach Sarahs Unfall beendet hat.
Jordan bemerkt, dass Jonathan ein Inhalator bei sich trägt, den dieser jedoch als den von Candice ausgibt. Sam bringt Lucy zu einem Gespräch mit Lois, wobei er verbietet, Ally zum Thema zu machen. Trotzdem schaffen es Lois und Lucy, wieder eine Verbindung zueinander aufzubauen. Beim nächtlichen Footballspiel nimmt Jonathan die Position von Timmy ein, woraufhin Jordan mitbekommt, dass Timmy denselben Inhalator bei sich hatte und deswegen nicht spielen konnte. Jordan versteht, dass Jonathan X-Kryptonite verwendet hat, und stellt ihn zur Rede.
Es kommt zu einem Streit zwischen Lucy und Lois über Ally, woraufhin Lucy geht. Lana fordert Kyle auf, auszuziehen. Anderson beschuldigt Superman des Verrats, weil er Informationen zurückgehalten hat, und lässt ihn zusammen mit Tal-Rho inhaftieren.
Jonathan wird mit Candice's X-K erwischt, und Lois erfährt davon. Lana rät ihr, Jonathan zuzuhören, egal welche Erklärung er hat. Sarah vertraut sich Aubrey an, die ihr nahelegt, mit Kyle zu sprechen. Währenddessen erwacht Superman im Gefängnis neben Tal-Rho und bittet Anderson, Ally zu untersuchen. Anderson verletzt Tal-Rho, um Superman zur Preisgabe von Informationen zu zwingen. Die kryptonischen Brüder täuschen einen Kampf vor, um zu fliehen. Sie entkommen zu Tal-Rhos Festung, wo Supermans anderes Ich erklärt, dass er und sein Tal-Rho unzertrennlich waren, bis Tal-Rhos Frau ihn ermordete.
Anderson stiehlt X-K und Waffen des Projekts 7734, um Tal-Rhos Festung zu finden. Er verletzt Tal-Rho und tötet das seltsame Duplikat von Superman. Superman bringt Tal-Rho nahe der Sonne, um ihn zu heilen, bevor er ihn ins Gefängnis zurückbringt. Clark kehrt nach Hause zurück. Sarah sucht Kyle auf, während Dean versucht, Kyles Affäre zu seinem Vorteil zu nutzen. Doch Lana überredet seine Anhänger, diesen Skandal zu ignorieren. Mit einem Haftbefehl gegen ihn besucht Anderson Ally mit dem Anhänger der inversen Welt.
Ein Jahr zuvor verfolgt Natalie John während einer temporalen Anomalie und geht für sechs Monate verloren. In der Gegenwart erwacht John mit einer Hirnverletzung, während Natalie Schwierigkeiten hat, Clark zu vergeben. Sam entdeckt, dass Anderson die Anhänger gestohlen hat, während Lucy kryptische Abschiede verschickt. Chrissy schließt sich Anderson und dem Kult in den Minen an, wo sie ein Portal zur umgekehrten Welt öffnen. Anderson stiehlt die Anhänger und tritt ein, doch Superman kann Chrissy und Ally herausziehen, während Lucy unauffindbar bleibt.
Währenddessen hilft Kyle der widerstrebenden Lana, sich auf die Fragen zu "Familienwerten" für ihr Debatte mit Dean vorzubereiten. In der Schule fragt Sarah Jordan, ob sie sich mit Aubrey treffen können. Die Fußball-Saison wird abgesagt, doch Jonathan schweigt über Candice und muss in einem kleinen Laden arbeiten. An diesem Abend verteidigt Jordan Jonathan und Candice gegen einen X-K-Dealer und sagt Sarah ab. Natalie verzeiht Clark, und er bietet ihr und John ein Haus von einem seiner alten Freunde an. Lucy erscheint an Lois' Tür und erklärt, dass sie zurückgeblieben ist. Sam bringt sie zu ihrer Wohnung, doch sie versetzt sein Getränk und stiehlt seine DOD-Schlüsselkarte für Ally.
Ally wurde aus der DOD entlassen und Superman verfolgt sie bis in die "Inverse-Welt". Ein Monat vergeht, ohne dass er zurückkehrt, daher übernimmt John vorübergehend seine Aufgaben. Am Wahltag verteidigt Lana Jonathan, als ein Elternteil ihn wegen der Footballsaison kritisiert. Währenddessen rettet Jordan heimlich Kyle aus einem Feuer, das John schließlich löscht. Er informiert Lois darüber, und sie ermahnt Jordan, seine Fähigkeiten nicht für Vigilantismus zu nutzen.
Natalie ist verärgert, weil John nicht daran gedacht hat, dass der Todestag ihrer Mutter ist. Sam erfährt, dass das Feuer an einem X-K-Umschlagsplatz ausgebrochen ist und verspricht Jonathan Immunität für seine Informationsquelle, woraufhin Candice gesteht. Sam und Lois werden in einem X-K-Herstellungszentrum gefangen genommen, aber Jordan kommt zur Rettung. Lana gewinnt die Wahl. John und Natalie versöhnen sich und sehen sich alte Videos von ihrer Version von Lois an. Sarah ist enttäuscht, dass Jordan den ganzen Tag gefehlt hat, und trennt sich von ihm, da sie das Gefühl hat, nicht an erster Stelle zu stehen.
Später erscheint der "Inverse Jonathan" im Haus der Kents und teilt Lois und Jordan mit, dass ihr Clark "zu spät" gekommen ist. Superman wird am Boden liegend gezeigt.
In Rückblicken werden die Geschichten der Bewohner der Inversen Welt gezeigt. Kal-El ist dort ein gefeierter Star und steht Tal-Rho nahe, der mit Lana verheiratet ist. Jahre später gerät Kal-El in den Bann seiner Berühmtheit und vernachlässigt seine Söhne. Jonathan, der als Jon-El bekannt wird, entwickelt Kräfte und schließt sich Ally an, ebenso wie Lana und Tal-Rho, die ebenfalls Kräfte erlangen. Lois und Jordan verlassen Kal-El und tauchen mit Sam unter, während Ally die Kontrolle über das DOD und die Medien übernimmt. Nach Andersons Ankunft scheitert sein Versuch, sich mit seinem anderen Ich zu vereinen, welches dann von Jon-El getötet wird. Mit Chrissys Hilfe findet Anderson Lois. Nach Supermans Ankunft versöhnt er sich mit Anderson, und sie kämpfen gemeinsam gegen Jon-El, Lana und Tal-Rho. Jon-El tötet Anderson und übergibt die Amulette an Ally, die sich mit ihrem anderen Ich vereint und Jon-El dazu anweist, das Gleiche zu tun. Jon-El verlässt die Inverse Welt und Tal-Rho ermöglicht es Superman, ihm zu folgen.
Superman kehrt rechtzeitig zurück, um Jon-El daran zu hindern, sich mit Jonathan zu vereinen. Clark nutzt Jonathans Visionen, um Jon-El zu verfolgen, wird jedoch von Lana aufgehalten. Sie weiß nicht, dass ein Monat vergangen ist oder dass sie die Wahl gewonnen hat. Am nächsten Tag bedroht Jon-El Sarah in ihrem neuen Auto und entführt Lana. Lois bemerkt dies und verschweigt Sarah die Wahrheit. Jon-El lockt Superman an und überwältigt ihn mit Kryptonit, während er die Inverse Lana herbeiruft. Diese trifft im Bergwerk ein und greift John und Natalie an, die nach X-K suchen. Natalie verletzt sie mit einem Messer, woraufhin sie in die Umgekehrte Welt flieht. Jordan stellt sich Jon-El entgegen und fliegt zum ersten Mal. Am Himmel gelingt es ihm, Jon-El auszuschalten, doch er droht selbst abzustürzen. Lana schafft es, rechtzeitig das Kryptonit zu entfernen, damit Superman sie befreit und Jordan rettet. Jon-El wird daraufhin in das Gewahrsam der DOD übergeben. Superman bringt Lana nach Hause und erklärt ihr, dass Jon-El nicht Jonathan ist. Mit Unterstützung seiner Familie teilt Clark Lana schließlich mit, dass er Superman ist.
Lana erfährt von Clarks Geheimnis und ist enttäuscht, dass ihre Freundschaft mit Lois auf einer Lüge beruhte. Ihre veränderte Art lässt Kyle vermuten, dass sie einen anderen Mann trifft. John und Sam schlagen vor, das Portal zur Inversen Welt zu zerstören, aber Clark widerspricht. Er befreit stattdessen Tal-Rho, weil ihre vereinten Kräfte das Amulett zerstören können. Ally greift ein und entzieht Superman seine Kräfte. John hält sie auf, und sobald das Amulett zerstört ist, fliehen sie und Tal-Rho. In der Zwischenzeit schwänzt Jonathan mit Jordan und Natalie seinen ersten Schultag. Natalie bietet ihm einen Anzug an, der verhindert, dass Jon-El mit ihm verschmilzt. Sie gehen in die Minen, um X-Kristalle für den Anzug zu finden, verlieren sie jedoch bei einem Einsturz. Später entschuldigt sich Lois bei Lana und verrät Jordans Geheimnis, erlaubt ihr jedoch, es ihrer Familie zu sagen. Letztendlich tut sie es nicht. Nachdem sie über Lana-Rho erfahren hat, beschließt Lana, den Kontakt zur Familie Kent vorübergehend zu unterbrechen. Kyle ermutigt Sarah, beim Open Mic-Abend in einer lokalen Bar aufzutreten. In der Inversen Welt entzieht Ally dem Inversen Tal-Rho die Kräfte und tötet ihn dabei.
In Rückblenden erfahren wir von den ersten Begegnungen zwischen Ally und Lucy vor fünf Jahren. John entdeckt, dass Natalie einen speziellen Anzug gebaut hat, und versucht erfolglos, ihn zu zerstören, da der Anzug unzerstörbar ist. Jordan überlegt, Sarah sein Geheimnis zu erzählen, sucht dafür Lanas Rat, die ihm rät, sich fernzuhalten. Später plagen Lana Zweifel über ihre Entscheidungen, und sie findet Trost bei Kyle. Clark versucht, Jordan aufzumuntern, indem er ihn in der Festung trainiert.
Währenddessen spüren Lois, Sam und Chrissy Lucy in einer Hütte in Burnham Woods auf, wo sie sich mit weiteren Mitgliedern der Inversen Gesellschaft aufhält. Ally taucht auf und beginnt, Sams Energie abzusaugen. Lucy ruft Superman zu Hilfe, doch auch er wird geschwächt, da Ally seine Energie absorbiert und ihn auf ein menschliches Niveau reduziert. John und Natalie schaffen es, Ally zu vertreiben und Superman beim DOD wiederzubeleben. Lucy und Sam versöhnen sich in Tränen aufgelöst. In der Zwischenzeit gibt Ally Lana-Rho den Befehl, Superman endgültig zu besiegen, und startet die Verschmelzung der beiden Welten.
Als die Welten zu verschmelzen beginnen, färbt sich der Himmel rot, die kubische Sonne der Inversen Welt erscheint und Objekte werden zwischen den Welten hin- und hertransportiert. John fliegt mit Clark zur Festung, wo Lara erklärt, dass es eine Weile dauern könnte, bis Clarks Kräfte zurückkehren. Trotz Sams Einwände informieren Lois und Chrissy Lana über Ally und die Verschmelzung der Welten. Bei einem Rathaus-Treffen gibt Lana diese Informationen preis und meint, Superman könne sie nicht retten. John sperrt Natalies Anzug und fordert sie auf, ihre neue Familie zu schützen. Er kämpft gegen Ally im Raum zwischen den Welten, wird jedoch besiegt und der Kontakt zu Natalie geht verloren. Lana-Rho befreit Jon-El, und gemeinsam greifen sie die Schule an, werden jedoch von Jordan und Natalie besiegt. Sarah beobachtet, wie Jordan seine Kräfte einsetzt, und erkennt, dass Lana dies bereits wusste, was sie verärgert. Plötzlich werden Kyle und die Familie Kent in die Inverse Welt transportiert.
Chrissy ermutigt alle, Zeit mit ihren Familien zu verbringen. Während die Menschen zwischen den Welten reisen, wird Lois von ihrer Familie getrennt. Natalie bringt John seine Rettungskapsel, und sie nutzen sie, um die Portale zu zerstören, wobei sie sich selbst einschließen. Tal-Rho kehrt zurück und bringt Superman zur Sonne, was Supermans Kräfte wiederherstellt und verstärkt. Anschließend rettet er John und Natalie, trennt Ally in zwei Personen und spaltet die Welten. Bei einer Feier trifft Lois wieder auf ihre Familie, Clark und Lana versöhnen sich, und Sarah und Jordan finden wieder zueinander. Lois teilt Chrissy mit, dass Clark Superman ist, und Lana erklärt Kyle, dass ihre Beziehung nicht mehr dieselbe sein wird. Beide Allys werden im DOD inhaftiert und gestehen Lois, dass sie sich unvollständig fühlten.
John Diggle besucht Irons, um herauszufinden, warum Bruno Mannheim den Irons dieser Erde getötet hat. Tal-Rho kauft Jonathan und Jordan Trucks und zieht nach Inverse Smallville, während Lucy nach Metropolis umzieht. Clark schafft ein neues Versteck für seine Familie im Ozean.