Während Captain Luthor auf der ganzen Welt nach Kryptonit sucht, nimmt Clark seinen Sohn Jordan mit zur Festung der Einsamkeit. Dort trifft Jordan eine virtuelle Version von Jor-El, die ihm hilft, die Geschichte Kryptons zu verstehen. In der Zwischenzeit wird Jonathan an der Smallville High heftig von Sean und dessen Freunden aus dem Schul-Footballteam gemobbt. Bei einem Stadtratstreffen stellt Lois Edge wegen seiner Pläne für Smallville zur Rede. Tests in der Festung zeigen, dass Jordans Kräfte unbeständig und sehr begrenzt sind, was Clark enttäuscht.
Die Kents besuchen ein Barbecue bei den Cushings, wo Lois sich mit Kyle über Edges Vorschläge streitet. Luthor greift General Lane im DOD an und bittet ihn, ihm zu helfen, Superman auszulöschen, bevor er zur Gefahr wird. General Lane gesteht Superman, dass er heimlich Kryptonit gehortet hat. Nachdem Edge ihren kritischen Bericht über ihn zu einem belanglosen Artikel im ''Daily Planet'' abmildert, kündigt Lois und schließt sich der ''Smallville Gazette'' an.
In seinem Versteck plant Captain Luthor, ein neues Schiff und eine Rüstung zu bauen, während er weiter nach Kryptonit sucht. Ein Rückblick auf Luthors Welt zeigt, dass er der letzte Überlebende einer Militäreinheit ist, die von einem bösen Superman ausgelöscht wurde.