Vor drei Jahren vergiftete Captain Milius die Bewohner von Level 3, darunter den früheren Admiral und seine eigene Frau, um die Macht an sich zu reißen. Melanie kehrt mit großen Sorgen um Geminis Sicherheit ins Silo zurück, basierend auf ihren Daten. Gemeinsam schaffen es Layton und Wilford, aus Level 3 zu entkommen und Melanie über die aktuellen Ereignisse zu informieren. Als Layton Josie und Liana aus Headwoods Fängen rettet, trifft Melanie wieder mit Alex zusammen, der ihr Bennetts Tod und seine Untersuchungen über das ungewöhnliche Wetter von New Eden offenbart. Melanie erkennt alarmiert, dass Gemini die Atmosphärenerosion verursacht, was das Ende allen Lebens auf der Erde bedeuten wird, wenn der Start nicht gestoppt wird. Doch Nima weigert sich zuzuhören, betäubt Melanie und kapert den ''Snowpiercer''.
Wilford stellt Milius zur Rede und überwindet ihn mit der Hilfe von Headwoods Kältebehandlung, was dazu führt, dass Milius erfriert. Als Layton Wilford für seine Verbrechen zur Rechenschaft ziehen will, begeht Wilford Selbstmord mit einem vergifteten Joint und enthüllt dabei, dass Nima der Erfinder von CW-7 ist, das die Eiszeit verursachte. Nima lässt daraufhin die Wagen mit Laytons Familie abkoppeln, was sie dem Erfrieren preisgibt. ''Big Alice'' erreicht fast ohne Energie das Gebiet von New Eden, doch der Zug wird durch eine Falle auf den Schienen gestoppt. Javi versucht, die Bombe zu entschärfen, aber sie explodiert.