Ein Jahr nach dem Tod von Direktor Phil Coulson baut S.H.I.E.L.D. (Marvel Cinematic Universe)|S.H.I.E.L.D. unter der Führung von Alphonso Mackenzie (Marvel Cinematic Universe)|Alphonso "Mack" Mackenzie wieder auf. Dabei untersuchen sie eine Reihe von Energieanomalien, die durch feindliche Fremde entstehen, die aus Portalen kommen. Einer dieser Fremden bleibt in einer Wand stecken und wird teilweise zu Beton.
Im tiefen Weltraum suchen die Agenten Daisy Johnson (Marvel Cinematic Universe)|Daisy Johnson, Jemma Simmons, Piper (Marvel Cinematic Universe)|Piper und Davis (Marvel Cinematic Universe)|Davis nach Leo Fitz, der zuletzt in einer Kryokammer auf einem Raumschiff mit dem Chronicoms (Marvel Cinematic Universe)|Chronicom Enoch (Marvel Cinematic Universe)|Enoch gesehen wurde. Sie finden das Raumschiff verlassen und die Kammer leer. Simmons erfährt, dass die Kammer auf Naro-Atzia gebaut wurde, doch die anderen beschließen, zur Erde zurückzukehren. Auf dem Rückweg werden sie von einem Kreuzer der Konföderation angegriffen und Simmons steuert in der Eile nach Naro-Atzia.
Mack und Melinda May rekrutieren Dr. Marcus Benson, um eine S.H.I.E.L.D. Akademie zu gründen und wissenschaftliche Unterstützung zu bieten. Sie finden Koordinaten auf dem Mann, der teilweise zu Beton wurde Tinker (Marvel Cinematic Universe)|Tinker, die sie zu einem Museum führen. Dort zerstören die überlebenden Feinde das Gebäude, um Platz für ihren Anführer Sarge (Marvel Cinematic Universe)|Sarge zu machen, der genauso aussieht wie Coulson.