Cole, Cassie, Hannah und Jennifer reisen nach Blackleaf, Montana, im Jahr 1852. Dort erkennt Hannah ihren Vater, Dr. Elliott Jones, und die Gruppe entdeckt, dass Elliott mit dem Blassen Mann und der Armee zusammenarbeitet, um den Hauptturm von Titan in Blackleaf zu errichten. Hannah kehrt mit Elliott ins Jahr 2043 zurück zum Project Splinter, wo Elliott und Jones herausfinden, dass die Armee Titan nutzen will, um ein Paradox auszulösen und den Roten Wald zu erschaffen. Cassie bemerkt, dass Jennifer ihre "Primary"-Fähigkeiten verloren hat.
Cole, Cassie und Jennifer treffen Tihkoosue von den Siksika, der ihnen von einer Waffe erzählt, die vergangene Primaries erschaffen haben, um den Zeugen zu besiegen. Trotz Tihkoosues Warnung trinkt Jennifer, um mit den alten Primaries über die Waffe zu sprechen, und verrät dabei Olivia das Team sowie die Existenz der Waffe und ihren Standort in Blackleaf. Elliott und Hannah reisen zurück nach Blackleaf und das Team entwickelt einen Plan, um die Energiekerne von Titan zu zerstören. Olivia schickt Deacon nach Blackleaf und vereitelt den Plan. Bevor er von Deacon getötet wird, gelingt es Elliott, die Entwürfe für Titan zu stehlen und sie Hannah zu übergeben.
Das Team kehrt ins Project Splinter zurück, wo Cole enthüllt, dass die Geschichte aus seiner Kindheit über die Waffe von seiner Mutter stammt. In der frühen Entwicklungsphase der Zeitmaschine von Project Splinter wird bekannt, dass Elliotts Assistentin Emma ein Mitglied der Armee und Olivias Tochter ist.