Im Jahr 2043 infiltrieren Cole, Cassie und Jones aus der Zukunft des Jahres 2046 die temporale Einrichtung. Dabei achten sie darauf, ihre eigenen Zeitlinien nicht zu stören. Jones bespricht die Zeitreise mit ihrem Selbst aus dem Jahr 2043 und nutzt dann die Zeitmaschine von 2043, um Cassie nach 1971 zu schicken, wo diese plant, die junge Olivia zu töten. Cole und Jones geben sich als ihre Versionen aus dem Jahr 2043 aus, um den Energiekern der damaligen Zeitmaschine zu stehlen. Währenddessen führen Cole und Jones emotionale Gespräche mit Ramse und Whitley aus der Vergangenheit von 2043.
Im Jahr 2018 in Prag untersucht Bonham, ein Interpol-Agent, Jennifers Diebstahl eines Artefakts. Jennifer stellt fest, dass ihre Primärfähigkeiten verschwunden sind und ihre alternative Persönlichkeit verschwindet. Während ihres Fluchtversuchs wird sie von Bonham am Bahnhof abgefangen, der sein Wissen über die 12 Monkeys offenbart. Als letzten Ausweg wirft sich Jennifer vor einen herannahenden Zug.